Voici 3 des scénarios possibles quant à l’origine des virus.
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1er scénario : les virus sont apparus avant les cellules. Les
virus auraient été autrefois « vivants », ils auraient eu un métabolisme. 
fonctionnel… Le fait que leur ARN  et ADN présente autant de similitudes
avec le notre et que certains gènes se retrouvent dans notre génome 
pourrait confirmer une telle hypothèse.
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2eme scénario : Ils sont apparus en même temps que les
premières cellules qui, les premières réussirent à se reproduire. Les
particules virales, qui en évoluant de façon parallèle en seraient
devenues des parasites.
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3èmescénario : Ils sont apparus après. Aujourd’hui toutes les
cellules peuvent être infectées par les virus ceci laisse à penser que les
virus sont apparus après. Durant l’histoire d’une cellule, elle aurait
rencontrée une période ou le fait de se rendre parasite était plus
avantageux que de rester une cellule normale. Les virus auraient donc
connu une évolution simplificatrice.
De tous ces scénarios,
aucun ne peut être
vérifié
expérimentalement, en
laboratoire, ils restent
des hypothèses
intéressantes certes
mais invérifiables. La
seule manière d’être sûr
de l’origine des virus
serait d’avoir assisté à
la naissance de ceux ci.